1.       Visi dan Misi

-           Visi

Visi Pesantren Al Musthafa Tsani adalah : Terwujudnya sumber daya insani yang SEBENARNYA (Agamis, Cerdas, Terampil, Unggul, Amanah dan Setia).

-           Misi

Misi Pesantren Al Musthafa Tsani adalah :

1.   Menerapkan proses pembelajaran aktif, kreatif, efektif dan menyenangkan

2.   Kajian pemahaman dan pengamatan nilai-nilai ajaran Islam

3. Pemberdayaan segenap profesi yang dimiliki dan mendorong lahirnya gagasan-gagasan kreatif, inovatif dan integratif.

4.   Pembinaan dan pengembangan rasa tanggung jawab dengan pendekatan dialogis menuju terbentuknya pribadi-pribadi yang amanah.

5.     Pembinaan dan memperkuat komitmen bersama untuk secara konsekwen dan konsisten mentaati peraturan demi tegaknya disiplin.

6.      Menjalin hubungan yang harmonis dengan lingkungan ( hablum minannas )